- Title: Automatic selection of region of analysis in bone marrow smears
- Description: Bakgrund: CellaVision utvecklar, marknadsför och säljer bildanalysbaserade system för rutinanalys av blod och andra kroppsvätskor. De primära kunderna är privata kommersiella laboratorier och sjukhus (hematologi/klinisk kemi laboratorium). Det finns ett intresse från kunder och distributörer om att även kunna göra en benmärgsanalys på systemen. Detta är en betydligt dyrare analys då den generellt sett utförs av läkare (patologer) och inte av biomedicinska analytiker (BMA) vilket är fallet för blod och kroppsvätskeanalysen. Det råder generellt sätt en stor brist på erfarna patologer och rekryteringen underifrån motsvarar inte de som går i pension. CellaVision har för avsikt att utveckla en benmärgsapplikation för att utöka vårt produkterbjudande och möta kunders önskemål men att utveckla en sådan är dock betydligt mer komplicerat i jämförelse med tidigare utvecklade applikationer. Därför har CellaVision initierat en förstudie som ska undersöka de tekniska utmaningarna samt skapa en uppfattning om hur stor marknaden är och vad marknadens krav på en sådan applikation är. CellaVision har under 2009 lanserat tredje generationens analysinstrument. Beskrivning av arbetet Syftet med examensarbetet är att utveckla en metod för att avgöra vilka områden på ett glas med ett benmärgsutstryk som lämpar sig för analys med CellaVisions automatiska system. I uppgiften ingår att dels ta hänsyn till bildbehandlingsmässiga aspekter såsom cellkoncentration dels kliniska aspekter såsom närhet till fragment. Målbeskrivning Exempel på deluppgifter som kan utredas inom ramen för examensarbetet. • Metod att hålla reda på vilka delbilder som är grannar och avstånd mellan dem. • Detektera fragment (som kan sträcka sig över flera bilder) • Bestämma cellkoncentration (t.ex. genom att räkna konturer) • Ta hänsyn till aspekter såsom att bilder som är granna bör ha liknande egenskaper. • Med hjälp av ovan ge förslag på ett eller flera sammanhängande områden på glaset lämpliga för analys eller om så är fallet detektera att inget lämpligt område finns. CellaVision uppmuntrar alltid innovativt tänkande och andra metoder för att lösa uppgiften kan bli de slutgiltiga. Implementation sker i ett första skede i valfri miljö t.ex. MATLAB. Om det ryms inom tidsplanen är det en fördel om en C++ metod som kan provköras ihop med övrig mjukvara färdigställes. Delmål: Att efter halva tiden kunna avgöra ett områdes lämplighet utan att ta hänsyn till närhet till fragment etc.
- Start Date: Aug. 30, 2010
- Finished Date: Jan. 16, 2011
- Supervisor: Niels Christian Overgaard
- Student: Ida Ekdahl
Questions: webmaster
Last update: 2013-04-11
Centre for Mathematical Sciences, Box 118, SE-22100, Lund. Telefon: +46 46-222 00 00 (vx)